Le maître d’ouvrage du programme "Sols de Bretagne" est Agrocampus Ouest (Institut supérieur des sciences agronomiques, agroalimentaires,  horticoles, et du paysage). Il est entouré de nombreux partenaires financiers et techniques.

Les partenaires financiers sont :
- l’Etat (GIS-Sol, services déconcentrés) 
- le Conseil Régional de Bretagne
- le Conseil Général des Côtes-d’Armor
- le Conseil Général du Finistère
- le Conseil Général d’Ille-et-Vilaine
- le Conseil Général du Morbihan
- les Chambres Régionale et Départementales d’Agriculture de Bretagne
- l'ADEME

Les partenaires techniques sont les suivants :
- experts consultés à différentes phases du programme
- les membres du CAREN
UMR Sol Agro et Hydrosystème Spatialisation INRA / Agrocampus Ouest, de part ses composantes Agrocampus Ouest (laboratoires de Science du Sol, Physique des Surfaces Naturelles et Spatialisation Numérique d’Agrocampus Rennes)
UMR Ecobio Université de Rennes 1 / CNRS
Laboratoire COSTEL (Climat Occupation du Sol par TELédetection), UMR Université de Rennes 2 / CNRS
- autres laboratoires de recherche
INRA Infosol Orléans
INRA Science du Sol Montpellier
- professionnels
Chambres Régionale et Départementales d’Agriculture de Bretagne
Bureaux d’études
Bretagne environnement
Observatoires départementaux de l’environnement (ODEM ...)
ADEME Bretagne
Agence de l’eau Loire-Bretagne
BRGM
Laboratoires d’analyses agricoles